中樞神經系統危害：主要表現有頭痛、頭暈、無力、記憶力衰退、睡眠障礙(失眠，多夢或嗜睡)、白天打瞌睡、易激動、心悸、胸悶、脫髮等，這些均說明大腦是抑制過程佔優勢。

機體免疫功能的危害使身體抵抗力下降，動物實驗和對人群受輻射作用的研究和調查表明，人體的白血球吞噬細菌的百分率和吞噬的細菌數均下降。

對心血管系統的影響在電磁輻射的作用下，周圍血像可出現白血球不穩定，主要是下降傾向，白血球減少、紅血球的生成受到抑制，出現網狀紅血球減少，對操縱雷達的人健康調查結果表明，多數人出現白血球降低。

對生殖系統和遺傳的影響長期接觸超短波發生器的人、可出現男人性機能下降，陽萎；高強度的電磁輻射可以產生逍傳效應，使睪丸染色體出現畸變和有絲分裂異常，失去生育能力。妊娠婦女在早期或在妊娠前，接受了短波透熱療法，結果使其子代出現先天性出生缺陷（畸形嬰兒）。

對視覺系統的影響：眼組織含有大虽的水份，易吸收電磁輻射功率，而且眼的血流量少，故在電磁輻射作用下，眼球的溫度易升高。溫度升高是造成產生白内障的主要條件，溫度上升導玫眼晶狀體蛋白質凝固，多數學者認為，較低強度的微波長期作用，可以加速晶狀體的衰老和混濁，並有可能使有色視野縮小和暗適應時間延長，造成某些視覺障礙。此外，長期低強度電磁輻射的作用，可促使視覺疲勞，眼睛感到不舒適和眼感乾燥等現象。